DOTTORATO DI RICERCA
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Progetti di Ricerca Scientifica della Unità BMGB nell’Ambito del  Dottorato di Ricerca in Biologia, Genetica Umana, BioInformatica: Basi Cellulari e Molecolari del Fenotipo

 

La caratterizzazione delle basi cellulari e molecolari delle Neoplasie e delle Malattie Degenerative è uno degli obiettivi fondamentali dell’attività di ricerca scientifica della nostra Unità BMGB nell’ambito del Dottorato di ricerca in Biologia, Genetica Umana, BioInformatica: Basi Cellulari e Molecolari del Fenotipo. In particolare, le nostre ricerche recenti sono state focalizzate sui seguenti modelli di neoplasia: (1) Neuroblastoma (NB); (2) Leucemia Mieloide Acuta (AML); (3) Carcinoma del Colon e del Retto (CRC); (4) Glioblastoma Multiforme (GBM). Quale modello di patologia degenerativa abbiamo analizzato (5) il Diabete Mellito (DM); nel prossimo futuro  intendiamo attivare un progetto di ricerca sul (6) Morbo di Alzheimer (AD).

(1A) La caratterizzazione della genomica e della trascrittomica dell’Apparato di Trascrizione di Homo sapiens e dei geni GTF (Fattori Generali di Trascrizione) (Genomics: 1994a, 1994b; Cytogenetics and Cell Genetics: 1995, 1996, 2000; Oncogene: 1998, 2001; Somatic Cell and Molecular Genetics: 1999; DNA and Cell Biology: 2007) ci ha consentito di utilizzare l’approccio del gene candidato  per verificare il loro coinvolgimento nella patogenesi di NB e dimostrare il ruolo patogenetico dei geni GTF NC2b, TAF12, TAF13. La  forte evidenza statistica sul ruolo patogenetico di NC2b è particolarmente interessante, alla luce della funzione biomolecolare di questa proteina, che è correlata alla modulazione negativa della trascrizione dei geni eucariotici delle tre classi ed alla modulazione negativa della proliferazione cellulare (Molecular Cancer: 2008).

(1B) In un’altra linea di ricerca correlata abbiamo dimostrato il ruolo importante svolto da tre microRNA (MIR152, MIR200B, MIR338) nella patogenesi di NB  (Journal of Molecular Medicine: 2010).

(2) La caratterizzazione delle Omiche (Genomica, Trascrittomica, Proteomica, Interattomica) del Macchinario Apoptotico (AM), effettuata dal nostro gruppo (BMC Medical Genomics: 2009), ci ha consentito di verificare e confermare sperimentalmente l’ipotesi che l’alterata espressione di specifici geni AM  determini la resistenza di alcuni pazienti con AML alla chemioterapia (BMC Cancer: 2010).

(3) Lo studio delle alterazioni del trascrittoma dei microRNA  dopo trattamento delle cellule in vitro con cetuximab ha reso possibile l’identificazione di specifici  profili molecolari, correlati alla risposta (positiva o negativa) dei pazienti con CRC  al farmaco (Molecular Cancer Therapeutics: 2010). Questo indirizzo di ricerca dovrebbe consentire la identificazione degli specifici genotipi coinvolti e la eventuale attivazione di specifiche strategie cliniche.

 (4) Il nostro gruppo ha recentemente identificato un gene microRNA, la cui sequenza codificante è sovrapposta a quella di un gene della seconda classe codificante una proteina. La caratterizzazione della struttura genomica di questo gene microRNA, del gene ospite, della loro espressione, delle networks cellulari regolate, e della espressione di entrambi nel GBM è quasi completata.

 (5) In un altro progetto di ricerca, abbiamo verificato il potenziale coinvolgimento dei microRNA e del Macchinario Apoptotico nella patogenesi del Diabete Mellito, analizzando le alterazioni del trascrittoma e del proteoma di cellule  a e  b dal pancreas murino, trattate con citochine. Questi esperimenti ci hanno consentito di caratterizzare le basi molecolari della maggiore resistenza delle cellule a rispetto alle  b al trattamento con citochine. Inoltre, abbiamo identificato nuovi geni candidati per il Diabete Mellito, nonché confermato candidati precedentemente identificati.

(6) I nostri studi sulle basi molecolari dell’infertilità femminile ci hanno consentito di dimostrare il coinvolgimento sia di alcuni geni GTF che di geni AM.

  

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